Jack est un samouraï banni par Aku, une entité maléfique. Le samouraï n'ayant pu détruire Aku, son futur est tout entier sous la coupe du mal. Son objectif est dès lors de retourner dans le passé afin d'empêcher son funeste destin.
La saison 5 a été produite plusieurs années plus tard pour [adult swim], le bloc de programmation adulte de Cartoon Network. pour répondre à la demande incessante des fans d'une suite avec une fin toujours aussi bien racontée par le maître Genndy Tartakovsky.